嵊泗古稱北界村，北宋熙寧六年(1073)設(shè)，屬昌國縣蓬萊鄉(xiāng)。
宋寶慶《四明志》卷二十：“蓬萊鄉(xiāng)，在縣東北海中二百五十里。
總五都，管里一，村三。
岱岸里。
岱山村、朐山村、北界村。”以地處昌國縣之北部，主島泗礁山島古稱北界山得名。
由之派生了北界坊、北界巡檢司等地名。
宋寶慶《四明志》卷二十在“酒”目下有北界坊名稱記載。
宋開慶《四明續(xù)志》卷四：“北界（酒）坊，月納一千一百五十三貫七百七十六文�！逼淙毒剖杖脒h(yuǎn)大于當(dāng)時稱為砂岸稅的漁業(yè)稅收入。
元大德《昌國州圖志》卷五：“巡檢司五處……北界，在蓬萊鄉(xiāng)之第五都弓兵三十名。”明洪武十九年（1386）因海禁，居民遷至內(nèi)陸，翌年北界村廢。
明洪武、清順治年間，嵊泗經(jīng)歷3次海禁。
清康熙二十七年（1688）展復(fù)，二十九年（1690）江浙兩省在嵊泗分汛劃界，從此進入兩省分治局面。
清光緒《崇明縣志》卷七：“康熙二十八年（二十九年）以浙盜猖獗申巡洋例，總兵梁鼐委左營游擊丁際昌等與浙江定海鎮(zhèn)左營游擊葉紀(jì)等分定洋汛，以洋山、馬跡山為界，馬跡山腳以南之洋島屬浙江，大羊山腳以北之洋島屬江南，自西至東，洋面山島俱以兩山為準(zhǔn)，立碑于小羊山�！笨滴跷迨辏�1711）第四次強遷嵊泗居民于內(nèi)陸。
乾隆年間逐漸再次展復(fù)，嵊泗仍為江浙兩省分治。
乾隆五十八年（1793），江浙兩省官員勘定盡山界的史實及界線走向，并于小洋山立“勘定盡山界碑”。
因此，明清及民國各類志書無嵊泗政區(qū)名稱記載，僅在“山川”“汛地”等條目下記載部分海島名稱。
1947年9月建立嵊泗設(shè)治局。
1949年10月置嵊泗縣。
“嵊泗”一名沿用至今。