清代屬臨海縣承恩鄉(xiāng)城門、關頭、吳都3莊。
民國時改莊為鄉(xiāng),1940年三門建縣后分屬城關、山場、雙溪3鄉(xiāng)。
解放初沿用舊制。
1950年由城關分設城關和下洋2鄉(xiāng),由山場分設山場和吳都2鄉(xiāng)。
1956年2月下洋鄉(xiāng)并回城關鄉(xiāng),吳都鄉(xiāng)撤銷,分別并入山場、關頭、小雄3鄉(xiāng)。
1957年由城關鄉(xiāng)析出,復建下洋鄉(xiāng),同年恢復吳都鄉(xiāng)。
1961年10月成立花橋、關頭、吳都3公社。
1983年9月改建為花橋、關頭、吳都3鄉(xiāng)。
1985年9月花橋鄉(xiāng)改制為鎮(zhèn),轄14村。
1992年5月撤銷吳都、關頭2鄉(xiāng),并入花橋鎮(zhèn),全鎮(zhèn)轄33村。
1996年蜍下村劃歸小雄鎮(zhèn)。
1998年花橋鎮(zhèn)東岙村分設東岙、上蘇、嶺下舒3村。
2018年行政村規(guī)模調整后,轄17個行政村。