建政時，為望里鄉(xiāng)護法寺村。

1956年合作化時，屬望里鄉(xiāng)第二高級社。

1958年公社化時，定名為望里管理區(qū)護法寺大隊。

1961年隸屬望里公社。

1984年改稱望里鄉(xiāng)護法寺村民委員會。

1988年9月，改稱望里鎮(zhèn)護法寺村民委員會。

2011年4月撤望里鎮(zhèn)，并入錢庫鎮(zhèn)，為錢庫鎮(zhèn)護法寺村民委員會。

2016年屬望里鎮(zhèn)。

2019年蒼南縣村規(guī)模調(diào)整，護法寺村、仙居山村合并成護法寺村。

2016年行政區(qū)劃調(diào)整后又歸屬于望里鎮(zhèn)。