唐代時(shí)期，遮島鎮(zhèn)境域?qū)倌显t。

宋代時(shí)期，屬大理國(guó)，地處梁河縣中部，九騰越府。

元至元二十六年（1289年），屬南甸軍民總管府。

明屬南甸宣撫司。

清咸豐元年（1851年)，南甸宣撫司署遷遮島。

民國(guó)二十二年（1933年），屬騰沖縣第六區(qū)。

民國(guó)二十三年（1934年），屬南甸宣撫司與梁河設(shè)治局共管。

民國(guó)二十四年（1935年），設(shè)立遮島鎮(zhèn)。

1958年，劃歸騰沖縣河西區(qū)九保鎮(zhèn)。

1959年，改設(shè)九保公社遮島大隊(duì)。

1961年，改為遮島區(qū)。

1964年，恢復(fù)遮島鎮(zhèn)。

1969年12月，屬紅旗公社，稱紅光大隊(duì)。

1971年9月，屬遮島公社，改稱遮島大隊(duì)。

1984年，又設(shè)遮島鎮(zhèn)。

2005年，杞木寨鄉(xiāng)水箐村并入遮島鎮(zhèn)。