明崇禎十五年（1642），噶丹頗章政權(quán)在申扎設(shè)立“那倉宗”尼瑪?shù)胤剑瑢佟澳莻}宗”管轄。
清咸豐年間（1856），西藏地方政府將那倉宗更名為申扎宗，尼瑪?shù)胤綄偕暝谳爡^(qū)。
1959年，設(shè)申扎縣，1976年前，現(xiàn)尼瑪縣所屬地為申扎縣管轄。
1976年12月，經(jīng)自治區(qū)黨委批準(zhǔn)，設(shè)立申扎縣西五區(qū)辦事處，為申扎縣辦事機(jī)構(gòu)。
西藏自治區(qū)黨委根據(jù)1978年《憲法》第34條關(guān)于“地區(qū)設(shè)立行政公署”的規(guī)定，撤銷“那曲地區(qū)革命委員會”，設(shè)立“那曲地區(qū)行政公署”。
同年1月，申扎縣西五區(qū)辦事處改稱“文布辦事處”，為獨(dú)立的那曲行政公署派出機(jī)構(gòu)，轄申扎縣西五區(qū)時期的5個區(qū)，22個鄉(xiāng)。
1983年10月，經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)，將文部、雙湖兩個辦事處合并成立尼瑪縣，隸屬那曲地區(qū)。
后因尼瑪縣并末成立，其轄區(qū)仍為文部、雙湖兩個辦事處，直至1993年8月尼瑪縣才正式對外宣布成立。
2017年7月，國務(wù)院下達(dá)《關(guān)于同意西藏自治區(qū)撤銷那曲地區(qū)設(shè)立地級那曲市的批復(fù)》（國函〔2017〕109號）同意撤銷那曲地區(qū)，設(shè)立地級那曲市，尼瑪縣屬那曲市管轄。