“維吾爾玉其溫”原為回屯舊地，定居建村已逾200年。

曾用玉其溫、伊力于孜等別名。

新中國成立前設(shè)百戶長管理屯務(wù)。

1950年建立人民政權(quán)時定名為九區(qū)二鄉(xiāng)，1952年改名三區(qū)二鄉(xiāng)，1954年又改名為四區(qū)七鄉(xiāng)，1958年更為團結(jié)公社五大隊，1959年改為六大隊，1972年析出克什拉克塔木大隊后，按駐地更為維吾爾玉其溫大隊，1975年1月由團結(jié)公社劃歸東風(fēng)公社，1978年東風(fēng)公社更名為東麻扎公社，本村隸屬于東麻扎公社，1984年8月劃入新建的維吾爾玉其溫鄉(xiāng)。

維吾爾玉其溫村設(shè)村委會，沿用人民公社時期的大隊名。