清光緒十四年(1888),新疆建省,在寧遠(yuǎn)城設(shè)伊塔兵備道,并設(shè)同知衙門與伊塔道共同治理伊犁。
1914年,寧遠(yuǎn)與湖南、陜西、遼寧、甘肅等省寧遠(yuǎn)縣重名,更名為伊寧縣。
1915年,伊犁道分設(shè)伊犁、塔城兩道,后伊犁道改為行政區(qū),屬之。
1932年,為喀什河為界析置鞏留縣、伊寧縣等5個(gè)行政區(qū)。
1950年6月,伊寧縣人民政府宣告成立,隸屬伊犁專員公署,轄15區(qū)、72鄉(xiāng)。
1952年,析置成立伊寧市。
1954年隸屬伊犁哈薩克自治州。
1957年,縣城遷駐吉里于孜。
1975年、恢復(fù)伊犁地區(qū)行政公署,伊寧縣屬之。
1979年,伊犁地區(qū)行政公署建制再度撤銷,伊寧縣復(fù)為伊犁哈薩克自治州直屬縣。
1985年1月,伊犁地區(qū)行政公署再次恢復(fù)伊寧縣屬之;同年撤社建鄉(xiāng),轄2鎮(zhèn)、16鄉(xiāng)、3牧場、2農(nóng)場。
2001年伊犁地區(qū)行政公署建制再次撤銷,伊寧縣屬伊犁哈薩克自治州。