解放前，轄境內(nèi)屬諸城縣。

1945年12月解放，屬藏馬縣泊里區(qū)。

1947年泊里區(qū)析置藏南區(qū)。

1956年藏馬縣并入膠南縣，屬泊里區(qū)。

1958年由泊里區(qū)析置橫河鄉(xiāng)，同年9月，與泊里、小場、貢口3個鄉(xiāng)合并成立泊里公社。

1961年從泊里公社分出原橫河鄉(xiāng)的55個村及新建的小塔山（村），組建藏南人民公社。

1984年3月，改為橫河鄉(xiāng)。

1987年8月，更名為藏南鄉(xiāng)。

1993年改為藏南鎮(zhèn)。

2001年2月，寨里鎮(zhèn)撤銷，將黃家營、六合橋、后溝、趙家溝、馬欄、七畝地6個村劃藏南鎮(zhèn)管理。

2005年藏南鎮(zhèn)轄43個行政村。

為傳承歷史文化需要和經(jīng)濟社會發(fā)展，2019年10月11日，山東省政府批復，藏南鎮(zhèn)更名為藏馬鎮(zhèn)。