元順帝年間（1333－1368），時稱睢寧集。

明正統(tǒng)十一年（1446），時設睢寧都，曹州屬地。

清康熙十三年（1674），仍稱睢寧集。

清康熙五十五年（1717）侯氏由山西洪洞縣遷此，侯姓居多，故名侯家集。

清雍正十三年（1735），現(xiàn)轄區(qū)屬景山里、向善里，民國間分屬曹縣第五區(qū)（古營區(qū)）和菏澤縣屬區(qū)。

1943年8月至1945年9月，屬曹縣五區(qū)（侯集）。

1945年9月屬復程縣第四區(qū)（侯集區(qū)）。

1947年7月屬復程縣第十一區(qū)（侯集區(qū)）。

1956年3月，改屬曹縣孫老家區(qū)。

1957年，撤區(qū)并鄉(xiāng)屬侯集鄉(xiāng)。

1958年初設立火箭人民公社，同年公社駐地遷王集，遂更名王集人民公社，轄區(qū)隨屬。

1962年再遷侯集，更名侯集人民公社。

1979年1月，將西部的王集、季集、張店、雙鋪、邵莊、韓樓、劉菜園、梁莊、丁莊、蘇樓、袁白莊11個大隊、47個自然村經(jīng)北部的陳集、大李莊、繆莊、張破鐘4個大隊劃歸安仁集鄉(xiāng)，將西南部曹白莊大隊劃歸東李集鄉(xiāng)。

1983年12月撤社建侯集鎮(zhèn)，1984年11月24日，經(jīng)山東省人民政府批準們更名侯集回族鎮(zhèn)，轄33個行政村。