朱子書院位于具有1087年歷史的同安縣衙舊址內,占地600平方米,分為門頭小院、書院講堂、高士軒館三部分,紅磚、燕尾脊、胭脂窗等點綴的建筑風格讓書院充滿濃郁的閩南風格。
從小院拾級而上,便是朱子書院講堂。進門是朱子胸像,胸像為紫銅所鑄,含底座高2.4米,寓意朱熹24歲到同安上任。胸像后靠屏風,上鐫刻朱子書院序。屏風后面是一幅《朱子游同安》的國畫。大廳北側兩層小樓為高士軒舊址,這里是朱子居家會友、讀書著作、格物致知之處,閩學發(fā)端之地。門左側外墻集中放置了三塊碑,為清康雍乾三朝地方官員重修高仕軒而作,此次維修時收集陳列于此。