1949年4月，為倪巷大隊，徐甲大隊，王巷大隊三個大隊。

1994年2月前，倪巷大隊、徐甲大隊、王巷大隊三個獨立的大隊隸屬于西陽鄉(xiāng)。

1994年2月，西陽撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)，倪巷大隊、徐甲大隊、王巷大隊三個大隊隸屬于西陽鎮(zhèn)。

2000年倪巷大隊、徐甲大隊、王巷大隊三個大隊合并更名為倪巷村。

2000年1月3日，茅麓鎮(zhèn)、西旸鎮(zhèn)合并為茅麓鎮(zhèn)，倪巷村隸屬于茅麓鎮(zhèn)。

2007年3月26日，茅麓鎮(zhèn)成建制并入原薛埠鎮(zhèn)，倪巷村隸屬于薛埠鎮(zhèn)。