秦廢金陵邑，于此置秣陵縣，因此得名。

漢初為秣陵縣；西漢元朔元年（前128）改秣陵侯國(guó)，后復(fù)為縣；王莽新朝改稱宣亭縣；東漢復(fù)舊名。

孫吳稱建業(yè)縣。

西晉復(fù)稱秣陵縣。

隋開(kāi)皇九年（589）廢入江寧縣。

轄境宋代屬馴翚鄉(xiāng)、隨車鄉(xiāng)、萬(wàn)善鄉(xiāng)、開(kāi)元鄉(xiāng)、朱門(mén)北鄉(xiāng)。

北宋景德二年（1005）始置秣陵鎮(zhèn)，設(shè)有秣陵驛、秣陵鋪。

元代設(shè)秣陵巡檢司。

明代置稅關(guān)，稱秣陵關(guān)。

清代秣陵鎮(zhèn)號(hào)為江寧縣三大鎮(zhèn)之一。

民國(guó)初稱秣陵市。

1928年名秣陵鎮(zhèn)。

1949年4月沿之。

1958年秣陵鎮(zhèn)改秣陵人民公社。

1982年改設(shè)秣陵鄉(xiāng)。

1989年1月撤秣陵鄉(xiāng)改設(shè)秣陵鎮(zhèn)。

2004年8月撤秣陵鎮(zhèn)改設(shè)秣陵街道至今。