周景王四年（前541），置瀨渚邑。

周景王五年，改名為陵平。

周景王十六年（前529），楚國攻打吳國，占領(lǐng)陵平，更名為平陵，屬楚國。

秦漢時期屬溧陽縣。

三國吳屬永平縣。

西晉太康元年（280），又恢復設立溧陽縣。

隋、唐屬溧水縣。

元屬溧水州。

明朝弘治四年（1491），析溧水縣西南部7鄉(xiāng)置高淳縣，屬應天府。

清屬江寧府。

1914—1927年，屬金陵道。

1934—1937年，屬江寧行政督察區(qū)。

1949年屬蘇南行署鎮(zhèn)江專區(qū)。

后曾屬江蘇省鎮(zhèn)江專區(qū)（地區(qū)）、常州專區(qū)。

1983年劃屬南京市。

2013年，由高淳縣更名為高淳區(qū)，名稱沿用至今。