明末清初，三倉屬揚州府。

泰州安豐場，清乾隆三十三年（1768年），屬揚州府東臺縣安豐場。

1912年12月，屬東臺縣安豐市。

1928年，設(shè)立三倉鎮(zhèn)，屬東臺縣第二區(qū)。

1941年，民主政府改以地名社區(qū)，設(shè)立三倉區(qū)，屬東臺縣。

1949年，三倉區(qū)轄1鎮(zhèn)12鄉(xiāng)。

1957年8月，撤區(qū)并鄉(xiāng)，劃建為三倉鄉(xiāng)。

1958年9月，撤銷三倉鄉(xiāng)，成立三倉人民公社。

1983年3月，撤銷三倉人民公社，設(shè)立三倉鄉(xiāng)。

1983年7月，撤銷三倉鄉(xiāng)，以其原轄區(qū)域設(shè)立三倉鎮(zhèn)，隸屬東臺縣。

1987年12月，東臺撤縣設(shè)市，屬東臺市，2001年7月1日，撤銷三倉鎮(zhèn)、新農(nóng)鎮(zhèn)，將原三倉鎮(zhèn)、新農(nóng)鎮(zhèn)所轄區(qū)域合并設(shè)立新的三倉鎮(zhèn)。