明代隆慶年間已形成集鎮(zhèn)，清屬梅城鄉(xiāng)，清末為馬口區(qū)，民國年間歸屬漢川縣，1929年全縣合并為六大區(qū)，馬口為第二區(qū)系馬鄉(xiāng)。

抗戰(zhàn)勝利后，1947年設(shè)馬口鎮(zhèn)轄系馬。

1949年，解放后仍設(shè)馬口鎮(zhèn)，并為漢川三大集鎮(zhèn)之一，轄新集鄉(xiāng)。

以后未變。

1958年9月，以區(qū)成立公社，馬口為馬口鎮(zhèn)公社，轄窯新、邱子、街道3個大隊。

10月與南河公社合并，改稱上游人民公社馬口管理區(qū)。

1959年4月。

上游公社改為馬口公社，屬馬口公社馬口管理區(qū)。

1959年6月，馬口管理區(qū)撤銷，建立馬口鎮(zhèn)公社。

1961年4月，恢復(fù)區(qū)建制，成立小公社，恢復(fù)馬口鎮(zhèn)建制。

1975年2月，撤區(qū)鎮(zhèn)并社，由馬口鎮(zhèn)和窯新公社合并，成立馬口鎮(zhèn)公社。

1984年，政社分開，撤銷公社恢復(fù)區(qū)鎮(zhèn)建制，為馬口鎮(zhèn)。

1985年，窯新為馬口轄區(qū)之管理區(qū)，并增設(shè)金馬管理區(qū)。

2001年4月將丁集鄉(xiāng)并入馬口鎮(zhèn)至今。