1930年已形成聚落。

東北淪陷后，屬鐵驪縣管轄。

1939年4月，設(shè)神樹村。

1943年7月，屬慶安縣。

1946年恢復(fù)鐵驪縣，設(shè)立神樹區(qū)。

1951年9月，改稱鐵驪縣第三區(qū)。

1955年5月，又改為神樹區(qū)。

1956年全縣并村劃鄉(xiāng)，神樹為14個鄉(xiāng)之一。

同年11月，屬鐵力縣。

1958年3月，將圣浪鄉(xiāng)并入神樹鄉(xiāng)。

同年9月，改神樹公社，隸屬慶安縣。

1962年10月鐵力恢復(fù)縣制，神樹公社重歸鐵力縣管轄。

1964年，將神樹公社改為神樹鎮(zhèn)公社。

1965年又恢復(fù)為神樹公社。

1977年1月，神樹公社改為神樹鎮(zhèn)。

1988年，屬鐵力市。

2001年3月，神樹鎮(zhèn)并入桃山鎮(zhèn)。

2018年5月恢復(fù)神樹鎮(zhèn)。