唐末至明萬歷二十八年（1600年），屬播州楊氏土官世襲領地。

次年，屬遵義縣東鄉(xiāng)樂安里。

清雍正六年（1728年），隨府縣改隸貴州省。

民國二年（1913年），屬東三上區(qū)、東三下區(qū)。

民國二十一年（1932年），始設新舟鎮(zhèn)，屬第五區(qū)。

1955年，改稱新舟區(qū)。

1958年，與蝦子區(qū)合并為蝦子基層公社。

1992年，復為新舟鎮(zhèn)。

2009年5月4日，遵義縣（今播州區(qū)）劃出新舟鎮(zhèn)，掛牌遵義市新蒲新區(qū)黨委工作委員會、新蒲新區(qū)管理委員會托管。

2012年8月，經(jīng)貴州省人民政府批準，設立貴州新蒲經(jīng)濟開發(fā)區(qū)，新舟鎮(zhèn)由托管。

2016年4月5日，貴州省政府辦公廳公布國務院對貴州省人民政府《關于調(diào)整遵義市部分行政區(qū)劃的請示》（黔府呈〔2015〕31號）作出批復，同意將原遵義縣的新舟鎮(zhèn)、蝦子鎮(zhèn)、三渡鎮(zhèn)、永樂鎮(zhèn)、喇叭鎮(zhèn)和遵義市匯川區(qū)的北京路街道劃歸遵義市紅花崗區(qū)管轄。

2016年—2019年，新舟鎮(zhèn)不變，由新蒲新區(qū)托管。