1949年前地屬柳江縣屏山鎮(zhèn)。

1950年為柳州市第三區(qū)。

1953年與第四區(qū)合稱柳州市第二區(qū)。

1955年撤區(qū)后分屬第十、十一、十二3個街道。

1958年撤銷街道辦事處，屬魚峰區(qū)南站、柳南、紅旗3個公社。

1960年屬魚峰公社。

1961年屬魚峰區(qū)南站、柳南2個公社。

1972年屬柳州市城區(qū)的南站、柳南個2公社。

1979年撤銷柳州市城區(qū)，以南站、柳南2個公社的全部轄地和柳石公社大部分轄地合置柳南區(qū)，柳南區(qū)人民政府駐飛鵝路華豐灣25號。

1998年12月26日，柳南區(qū)人民政府遷駐潭中西路10號。

2002年6月柳州市郊區(qū)撤銷，原屬柳州市郊區(qū)的太陽村鎮(zhèn)、西鵝鄉(xiāng)、羊角山鎮(zhèn)的新云、門頭、帽合3村及黃村鄉(xiāng)的渡口、基隆、磨灘3村劃歸柳南區(qū)轄。

2005年7月撤銷西鵝鄉(xiāng)，新設(shè)南環(huán)、潭西2街道。

2019年5月，根據(jù)廣西壯族自治區(qū)人民政府桂政函2019[56]號文和柳州市人民政府柳政發(fā)[2019]20號文件，將原柳江區(qū)洛滿鎮(zhèn)、流山鎮(zhèn)劃入柳南區(qū)管轄。