漢為蒼梧郡富川縣地。
三國吳為始安郡平樂縣地。
隋義寧二年（618）分置茶城縣，治今恭城河東南岸江貝村老縣垌，因當?shù)厥a(chǎn)茶葉得名，屬始安郡。
唐武德四年（621）改恭城縣，傳因前茶稅苛重，減免后以近似字改名，屬樂州；貞觀八年（634）屬昭州。
北宋太平興國元年（976）縣治遷北鄉(xiāng)龍渚市（今栗木鎮(zhèn)上宅村大源頭）。
南宋景定五年（1264）縣治遷回原址。
元大德五年（1301）屬平樂府。
明成化十三年（1477）縣治徙今址。
明、清沿襲。
1913年屬漓江道。
1914年屬桂林道。
1930年屬廣西省第二民團區(qū)。
1932年屬桂林民團區(qū)。
1933年屬平樂民團區(qū)。
1934年屬平樂行政監(jiān)督區(qū)。
1940年屬廣西省第二行政督察區(qū)。
1942年屬廣西省第一行政督察區(qū)。
1949年12月11日，恭城解放，劃屬平樂專區(qū)轄。
1958年屬桂林專區(qū)。
1971年屬桂林地區(qū)。
1990年2月3日，國務院批準恭城縣實行民族區(qū)域自治，設立恭城瑤族自治縣，以原恭城縣的行政區(qū)域為恭城瑤族自治縣的行政區(qū)域。
1998年屬桂林市。