明嘉靖三年（1524年），岐石屬惠來縣。

民國二十五年（1937年），屬隆江區(qū)鏊梅鄉(xiāng)。

1949年7月，屬隆江區(qū)。

1951年12月，歸第五區(qū)管轄。

1958年9月，撤銷鄉(xiāng)鎮(zhèn)建制，設立五個公社，岐石鄉(xiāng)屬紅光公社。

1958年12月14日，撤銷惠來縣建制，紅光公社劃歸普寧縣。

1961年3月，恢復惠來縣建制，設置岐石公社。

1983年11月9日，設區(qū)建鄉(xiāng)，岐石為區(qū)。

1986年11月8日，設岐石區(qū)改鎮(zhèn)。

2003年5月15日，原南海鄉(xiāng)管轄的朱埔、和雙、雙湖行政村劃歸岐石鎮(zhèn)管轄。