東源縣地域?yàn)樵釉纯h主體。
南朝齊永明元年（483）從龍川析置河源，屬南海郡。
唐肅宗乾元元年（758）屬循州。
宋太祖開(kāi)寶四年（971），屬禎州。
明太祖洪武元年（1368），屬惠州府。
清屬惠州府。
1925年屬東江行政區(qū)。
1949年屬東江專區(qū)。
1953年屬粵東行政區(qū)。
1956年屬惠陽(yáng)專區(qū)。
1959年屬韶關(guān)專區(qū)。
1963年至1987年屬惠陽(yáng)地區(qū)。
1988年1月，經(jīng)國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)，撤銷河源縣，設(shè)立河源市，原河源縣分設(shè)河源市源城區(qū)和河源市郊區(qū)。
1993年11月8日，撤銷河源市郊區(qū)，設(shè)立東源縣。