瑪曲古稱羌區(qū)析支河流域。
《后漢書》記載：西周穆王時(shí)，西征犬戎獲其五王，又獲四白鹿。
《安多政教史》、《西藏王統(tǒng)記》亦稱：占據(jù)高原三峰者藏族六大姓之一，以白鹿為圖騰的董氏（黨項(xiàng)羌）印迷所屬瑪柯（河曲）部繁衍于此。
春秋戰(zhàn)國(guó)時(shí)，董氏后裔已發(fā)展成許多部落。
秦時(shí)仍屬董氏控制。
漢時(shí)，嶺王國(guó)天子（自稱）屬地，按姓氏仍屬董，按地區(qū)屬滇零之“鐘存部”。
三國(guó)時(shí)，河曲之地屬迷唐羌分支和夷之地。
晉、南北朝時(shí)，黃河首曲屬黨項(xiàng)彌藥地區(qū)。
隋時(shí)大部屬河源郡。
唐時(shí)為吐蕃將軍悉參（節(jié)度使）多彌衛(wèi)（衛(wèi)府設(shè)在河曲）屬同�。ㄖ荩┚胖萘恐坏默斂露希h項(xiàng)遺部）。
宋時(shí)屬吐蕃諸部脫思麻（多彌）地區(qū)。
元時(shí)為吐蕃等處宣慰司之脫思麻路，此地仍稱嶺地。
明朝時(shí)，除卓格尼瑪屬陜西都司洮州衛(wèi)外，其余嶺地均屬朵甘都司贊善王分地的巴西諸部。
清時(shí)屬蒙古厄魯特部。
清雍正元年（1723）發(fā)生“羅卜藏丹津叛清事件”后，屬清朝欽差辦理青海蒙古番子事務(wù)大臣管轄。
清乾隆四十二年（1777）夏河拉卜楞寺院在河曲組成第一個(gè)流官制部落--歐拉部落。
清光緒二十四年（1898）河曲南北盡歸拉卜楞寺管轄。
1928年屬甘肅省夏河縣，但其政令唯有通過拉卜楞寺院才能在河曲各部施行。
1949年9月18日，夏河縣解放以后，為夏河縣第七區(qū)。
1953年3月中共歐拉工委、歐拉行政工作組正式進(jìn)入黃河第一彎開展工作，是年9月改為瑪曲工委和瑪曲行政委員會(huì)。
1955年6月，經(jīng)甘肅省人民委員會(huì)批準(zhǔn)建縣。
因瑪曲地臨黃河，而黃河藏語稱“瑪曲”而得名，隸屬甘南藏族自治州。
1959年1月1日，瑪曲、碌曲合并，稱洮江縣；1962年1月1日，撤銷洮江縣，恢復(fù)瑪曲、碌曲兩縣建置。