明、清屬溪南里。

民國時期屬第二區(qū)、溪南區(qū)，并區(qū)后屬第一區(qū)，后又稱大院鄉(xiāng)。

1949年新中國成立后屬金砂區(qū)、溪南區(qū)、第八區(qū)。

1957年，改稱仙師鄉(xiāng)。

1958年改仙師公社。

1966年至1976年時稱立新公社。

1980年復稱仙師公社。

1984年改稱仙師鄉(xiāng)，轄仙師、務田、蘭崗、錦豐、石鼓、恩全、華僑、三壩、金寨、大阜、秀富、書華、九坑、西洋等14個村委會。

1989年9月，從務田村劃出大坪、嶺背、車前壩、楊梅下4個自然村設大嶺村。

2000年，因移民安置，撤銷華僑村，增設華坊、新僑兩個村。

2014年10月，福建省政府下文批復同意永定縣撤銷仙師鄉(xiāng)，設立仙師鎮(zhèn)。

設立的仙師鎮(zhèn)，以原仙師鄉(xiāng)的行政區(qū)域為仙師鎮(zhèn)的行政區(qū)域，政府駐地不變。