1949年前屬吳乾保，1949年至1952年屬奧杳村人民政府管轄，1953年至1957年屬奧杳鄉(xiāng)人民政府管轄，1958年至1961年設(shè)奧杳管理區(qū)，1961年5月設(shè)四個(gè)大隊(duì)為吳屋大隊(duì)，1965年冬又拼為奧杳大隊(duì)，1968年冬至1978年冬設(shè)奧杳大隊(duì)革命領(lǐng)導(dǎo)小組，1977年又分為四個(gè)大隊(duì)為吳屋大隊(duì)，因原有大隊(duì)部建有學(xué)校一所，大隊(duì)部設(shè)在學(xué)校旁，而取名為新學(xué)大隊(duì)，1984年8月建鄉(xiāng)稱為湖坑鄉(xiāng)吳屋村民委員會(huì)。

1993年撤鄉(xiāng)設(shè)鎮(zhèn)后，改稱為湖坑鎮(zhèn)吳屋村民委員會(huì)至今。