商代地屬南疆，故名南巢。

周代為巢（伯）國地。

春秋時(shí)期為楚屬國，置巢邑。

秦統(tǒng)一后，置郡縣，今巢湖以南為居巢縣，也作居鄛。

劉宋大明三年（459），居巢易名蘄。

漢設(shè)居巢縣，屬廬江郡。

西晉分設(shè)為廬江郡居巢、臨湖、襄安3縣。

東晉改為蘄縣，屬南譙郡。

南朝梁屬合州。

隋開皇元年（581），改為襄安縣，屬廬江郡。

唐武德三年（620）置巢州。

唐武德七年（624），置巢縣，隸屬廬州。

北宋太平興國三年（978），設(shè)無為軍，巢縣隸屬之。

元至元二十三年（1286），稱巢州。

至元二十八年，稱巢縣。

明屬南直隸廬州府。

清初屬江南省廬州府。

清順治十八年（1661），巢縣屬廬州府。

康熙元年（1667），改屬江南左省。

清康熙六年，屬安徽省廬州府。

1912年1月，直屬安徽省。

1914年6月，屬安慶道。

1949年4月21日，屬皖北行署巢湖專區(qū)。

1952年2月4日，改屬安徽省蕪湖專區(qū)。

1958年8月7日，改屬合肥市。

1961年4月13日，復(fù)屬蕪湖專區(qū)。

1965年7月14日，屬巢湖專區(qū)。

1971年8月29日，巢湖專區(qū)改稱巢湖地區(qū)。

1983年1月4日，撤縣改市成立巢湖市，隸屬不變。

1999年7月9日，縣級(jí)巢湖市改設(shè)為居巢區(qū)，隸屬地級(jí)巢湖市。

2011年8月，居巢區(qū)改設(shè)為縣級(jí)巢湖市，由合肥市代管。