南宋寶祐五年(1257),宋理宗御批“荊山為城,義在懷遠(yuǎn)”,置懷遠(yuǎn)軍。
元至元二十八年(1291)廢軍,改為懷遠(yuǎn)縣。
清代,懷遠(yuǎn)縣屬安徽省鳳陽府。
1912年,懷遠(yuǎn)縣直屬安徽省。
1914年,改屬淮泗道。
1928年,直屬安徽省。
1938年2月,懷遠(yuǎn)縣境被日軍侵占。
1949年1月,懷遠(yuǎn)縣全境解放,3月宿懷縣、懷遠(yuǎn)縣合并為懷遠(yuǎn)縣。
中華人民共和國成立后,懷遠(yuǎn)縣仍屬于宿縣專區(qū)。
1983年7月,改屬蚌埠市,轄縣至今。